Los estudios de ADN antiguo están permitiendo conocer nuevos datos sobre la biología de especies actuales y extintas. Las técnicas de ADN antiguo pueden ser una herramienta adicional y complementaria dentro de los estudios multidisciplinares que son necesarios para abordar distintas problemáticas arqueopaleontológicas. En este artículo repasamos algunas de las aplicaciones en estos contextos: la determinación taxonómica y sexual, los estudios para conocer el proceso de domesticación, o la estructura filogeográfica durante ciclos glaciares subrayando la existencia o no de refugios glaciares. También proporcionamos información preliminar referente a la aplicación de estas técnicas en el yacimiento de Arlanpe (Lemoa, Bizkaia). En este yacimiento hemos obtenido ADN mitocondrial de muestras de oso pardo, gran bóvido y cabra montés. Una de las muestras de oso pardo de Arlanpe está dentro del clado 3c compuesto de osos pardos extintos de Alaska. Dos de las muestras de gran bóvido de Arlanpe han sido clasificadas como uro (Bos primigenius) mediante métodos genéticos.