En las inmediaciones de la actual Mezquita-Catedral de Córdoba se conserva un imponente edificio cuya secuencia estratigráfica es muy compleja y su andadura histórica muy dilatada. Esta construcción, que a partir del siglo XIII funcionó como iglesia del antiguo convento de Santa Clara, ha sido objeto de numerosos estudios arqueológicos y arquitectónicos que no siempre han estado interconectados, generando numerosas dudas aún por esclarecer. Esta realidad, junto con la necesidad imperante de la revisión de las estructuras, tanto emergentes como exhumadas en el subsuelo, de la citada construcción, nos ha motivado a estudiar y a contextualizar de forma crítica su secuencia estratigráfica bajo imperial, tardoantigua y andalusí (siglos III-XIII). Gracias a dicho análisis hemos podido matizar antiguas interpretaciones y plantear otras nuevas que pueden contribuir a mejorar nuestro conocimiento tanto de una polémica construcción preislámica vinculada a las clases dirigentes (domus o iglesia), como de la posterior mezquita califal.